有機(jī)農(nóng)場應(yīng)有豐富的有機(jī)質(zhì)回歸土壤中，供為土壤生物及有益微生物的糧食。用以豐富土壤微生物，繁殖微生物族群，增進(jìn)微生物活性。這些活躍的微生物分泌的膠結(jié)物質(zhì)和菌絲，有助于形成土壤團(tuán)粒構(gòu)造。微生物對有機(jī)質(zhì)的礦質(zhì)化，也有重要的功能。所以充分供應(yīng)土壤有機(jī)質(zhì)，是有機(jī)農(nóng)場土壤肥培管理的基礎(chǔ)。在施用有機(jī)肥時(shí)，應(yīng)防止重金屬及其它污染物質(zhì)的累積，且應(yīng)維持適當(dāng)?shù)耐寥?/span>ph值。 

    補(bǔ)充土壤中營養(yǎng)元素的好材料，當(dāng)然是腐熟的有機(jī)肥。有機(jī)肥中除含有機(jī)碳源，可以供應(yīng)土壤微生物充足的食糧外。這些有機(jī)質(zhì)肥料并含有豐富而均衡的氮、磷、鉀以及微量元素，對作物根系的發(fā)展以及植株的生育，有重要的功能。

    有人不明了化學(xué)肥料為什么不能用在有機(jī)栽培上，這牽涉到化學(xué)肥料的制造過程。我們都知道化學(xué)肥料制造過程中，耗費(fèi)了大量的能源，這與有機(jī)農(nóng)法低投入的哲學(xué)，是互相抵觸的。但主要的原因還不在這里，我們用得比較多的肥料，包括硫酸銨、過磷酸鈣和硫酸鉀，在制造的過程都添加了硫酸。這些化學(xué)肥料施用到土壤，等到銨、鉀離子及磷酸根被植物吸收之后，剩下硫酸根殘留在土壤中，結(jié)果使得土壤急速的酸化。土壤急速酸化的結(jié)果，造成土壤中許多營養(yǎng)元素有效性降低，微生物活性降低，重金屬溶解度增加。此外，過剩的硝酸鹽淋洗進(jìn)入地下水，污染水資源。磷酸鹽被沖刷流入水庫或湖泊，造成水庫湖泊的優(yōu)養(yǎng)化，對生態(tài)有不利的影響。蔬菜吸收太多的氮素，形成硝酸鹽含量過高，對人體健康也有不良影響。有機(jī)肥以緩效性分解釋放，均衡養(yǎng)分，不致造成某些元素過量吸收之問題。 

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